根据教育部全国第四轮学科评估结果，石河子大学农业工程、化学工程与技术被评为B类学科。工商管理、园艺学、畜牧学、基础医学、作物学、临床医学被评为C类学科。
一、2024年石河子大学B类学科情况一览
| 学科 | 学科评级 | 所属专业类 |
|---|---|---|
| 农业工程 | B- | 工学 |
| 化学工程与技术 | B- | 工学 |
二、2024年石河子大学C类学科情况一览
| 学科 | 学科评级 | 所属专业类 |
|---|---|---|
| 工商管理 | C+ | 管理学 |
| 园艺学 | C | 农学 |
| 畜牧学 | C | 农学 |
| 基础医学 | C | 医学 |
| 作物学 | C | 农学 |
| 临床医学 | C- | 医学 |
| 农林经济管理 | C- | 管理学 |
| 兽医学 | C- | 农学 |
| 教育学 | C- | 人文社科类 |
| 应用经济学 | C- | 人文社科类 |
附：教育部评级比例
| 评估结果 | 全国排名 |
|---|---|
| A+ | 前2%（或前2名） |
| A | 2%～5%（不含2%，下同） |
| A- | 5%～10% |
| B+ | 10%～20% |
| B | 20%～30% |
| B- | 30%～40% |
| C+ | 40%～50% |
| C | 50%～60% |
| C- | 60%～70% |
