南京工程学院王牌专业有自动化、能源与动力工程、电气工程及其自动化等专业，这些都是南京工程学院的国家级特色专业。 机械设计制造及其自动化、机械电子工程、材料科学与工程、能源与动力工程、电气工程及其自动化等专业为南京工程学院国家级一流本科专业。 以下是具体专业名单一览表，供大家参考，如有变动，以学校最新公布为准。
一、南京工程学院国家级特色专业
| 编号 | 专业名称 |
|---|---|
| 1 | 自动化 |
| 2 | 能源与动力工程 |
| 3 | 电气工程及其自动化 |
二、南京工程学院国家级一流本科专业
| 编号 | 专业名称 |
|---|---|
| 1 | 机械设计制造及其自动化 |
| 2 | 机械电子工程 |
| 3 | 材料科学与工程 |
| 4 | 能源与动力工程 |
| 5 | 电气工程及其自动化 |
| 6 | 电子信息工程 |
| 7 | 市场营销 |
| 8 | 产品设计 |
一流专业名词解读：一流本科专业，是指教育部以一流本科教育为基础实施“双万计划”建设的本科专业。计划在2019—2021年间，建设10000个左右国家级一流本科专业点和10000个左右省级一流本科专业点。
